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Otra bola curva más en la pesadilla de la mutación COVID

Cuando la industria farmacéutica se apresuró a desarrollar las primeras vacunas contra el COVID en 2020, tenía sentido que los desarrolladores se centraran en la parte del virus que le permite agarrar e infectar nuestras células: las proteínas de punta.

Las mejores vacunas contienen una parte de la espiga, o datos genéticos sobre el pico, cualquiera de los cuales puede estimular una respuesta inmune. Para no quedarse atrás, el virus ha estado mutando, con muchos de los cambios ocurriendo en ese mismo pico.

Pero otras partes del virus también están cambiando. Ahora, por primera vez, un equipo de científicos analizó estos cambios y emitió una advertencia.

“Con cada variante importante que se ha identificado, estamos viendo mutaciones fuera de [the] pico que estamos tratando de resolver”, dijo a The Daily Beast Matthew Frieman, inmunólogo y microbiólogo de la Facultad de Medicina de la Universidad de Maryland y autor principal del nuevo estudio.

Es posible que el virus esté acumulando mutaciones sin picos en un intento de obtener alguna ventaja sobre nuestra inmunidad colectiva a medida que la pandemia de COVID avanza hacia su cuarto año. Es posible que estas nuevas mutaciones no hagan que el virus sea más infeccioso como lo hacen las mutaciones de pico, pero podrían estar asociadas con más extenso infecciones

Si esta tendencia continúa, y no hay razón para creer que no lo hará, eventualmente podríamos necesitar nuevos medicamentos antivirales y nuevas formulaciones de vacunas que no estén tan específicamente enfocadas en el pico.

Los desarrolladores de vacunas no se equivocaron al centrar sus esfuerzos iniciales en la proteína espiga, explicaron Frieman y sus coautores en su estudio revisado por pares, que se publicó en procedimientos de la Academia Nacional de Ciencias y apareció en línea el martes. “La proteína espiga es el antígeno inmunodominante”, escribieron. En otras palabras, es la parte del virus con mayor probabilidad de producir una fuerte respuesta inmunológica.

Además, las principales variantes y subvariantes de SARS-CoV-2 (Delta y luego las diversas formas de Omicron, incluidas BA.4 y BA.5) han acumulado mutaciones en el pico. A medida que evoluciona el pico, el virus se vuelve cada vez mejor para agarrarse a nuestras células a pesar de la presencia de anticuerpos.

Esa es una de las razones por las que las vacunas se han vuelto algo menos efectivas, y estamos viendo cada vez más casos de avances en personas vacunadas. Y no debería sorprender que uno de los principales contendientes para la siguiente subvariante dominante, un derivado de Omicron llamado BA.4.6, presente una mutación particularmente preocupante en el pico llamada R346T.

Pero ha habido indicios de que las mutaciones que no son picos también se están convirtiendo en un factor más importante. Los genetistas notaron que BA.5, actualmente la subvariante dominante, no solo tiene mutaciones a lo largo de su espiga, sino que presenta cambios en toda su estructura.

Frieman explicó que tenía que haber una razón para esas mutaciones. “Los virus no hacen las cosas por accidente”. En su lugar, prueban pequeños cambios, una y otra vez, hasta que alguna combinación de cambios ayuda a que sobreviva y se propague. La variante o subvariante resultante luego supera a otras formas del patógeno hasta que se vuelve dominante, y la base probable para la próxima conjunto de mutaciones.

Para comprender el motivo y los efectos de las mutaciones que no son picos, el equipo de Frieman clonó el SARS-CoV-2 y luego comenzó a eliminar las proteínas pico y a probar los “virus de eliminación” resultantes en ratones, evaluando qué tan contagiosos eran los virus y qué tan graves. las infecciones eran.

¿Su conclusión? “Mutaciones fuera de [the] el pico puede estar impulsando fenotipos críticos de infección y enfermedad por SARS-CoV-2”. Es decir, los cambios más allá del pico empiezan a definir al virus.

Por ahora, parece que las mutaciones espiga y no espiga funcionan juntas. Las mutaciones de pico hacen que el virus sea cada vez más contagioso. “Mutaciones en [the] Se han identificado picos en todas las variantes principales que luego superan a la variante anterior”, explicó Frieman.

Mientras tanto, las mutaciones que no son pico parecen prolongar la infección. Esto, a su vez, le da al patógeno más tiempo para mutar dentro de una persona en particular y también para propagarse a otras personas. “Presumimos que este equilibrio es fundamental para una mayor evolución del SARS-CoV-2”, escribió el equipo de Frieman.

A medida que el virus continúa probando mutaciones para adelantarse a nuestra inmunidad enfocada en picos, podría enfatizar aún más los cambios más allá del pico. BA.5, con su amplia gama de mutaciones, es una señal de que ya está sucediendo.

Tome esto como una llamada urgente para un mayor estudio de las mutaciones que no son picos. “A medida que surjan más variantes, identificaremos mutaciones adicionales fuera de [the] pico que contribuye significativamente a la replicación, transmisión y patogénesis viral”, escribieron Frieman y sus coautores.

Frieman dijo que su objetivo es escudriñar estas mutaciones sin espigas para “descubrir qué hacen, cómo lo hacen”. [and] por qué hacen que el virus sea mejor siendo un virus”. “Entonces podemos usar esa información para fabricar medicamentos”, incluidas nuevas terapias antivirales y formulaciones de vacunas.

La velocidad importa. La variante de Omicron y sus subvariantes de disparo rápido, cada una de las cuales apareció solo un par de meses después de la última, fue una advertencia de que nuestros procesos de investigación y desarrollo farmacéuticos podrían ser demasiado lentos. Tenga en cuenta que la Administración de Drogas y Alimentos de los EE. UU. la semana pasada dio luz verde a los refuerzos de vacunas específicos de Omicron, 10 meses completos después de que la variante inicial de Omicron se volviera dominante por primera vez. “Omicron y sus linajes”, otro término para subvariantes, “nos enseñaron una lección sobre la necesidad de ser más ágiles en la modificación de la vacuna”, dijo Ali Mokdad, profesor de ciencias de la métrica de la salud en el Instituto de Salud de la Universidad de Washington, a The Washington Post. Bestia diaria.

Ese problema podría empeorar si se acelera la tasa de mutaciones que no son picos. Nuestra investigación y desarrollo de vacunas es demasiado lenta incluso cuando se enfoca estrechamente en el pico. ¿Qué sucede cuando necesita ampliar su alcance para combatir un virus que está aprendiendo a mutar en su estructura?

Hay otra arruga. Estas mutaciones acumuladas en el nuevo coronavirus, en el pico y no en el pico, podría comenzar a interferir con las pruebas de reacción en cadena de la polimerasa que usamos para detectar y rastrear el virus.

Las pruebas de PCR y la secuenciación utilizan cebadores adaptados a una cierta gama de características virales. Demasiadas mutaciones “pueden alterar la prueba de PCR”, dijo a The Daily Beast Niema Moshiri, genetista de la Universidad de California-San Diego.

Presta atención, pero no entres en pánico. Realmente no sorprende que el SARS-CoV-2 esté probando mutaciones en diferentes partes del virus. Eso es lo que hacen los virus: adaptarse. El truco para nosotros, el anfitrión del nuevo coronavirus, es adaptarnos al menos con la misma rapidez.

Lo hicimos antes al desarrollar rápidamente vacunas y terapias dirigidas a la parte más peligrosa del virus. Podemos hacerlo de nuevo a medida que el virus encuentre nuevas formas de evolucionar. Solo se necesita voluntad política… y dinero.